Filmen inleds med en "kaninernas skapelseberättelse", där kaninernas tillkomst och roll bland de andra djuren presenteras. Guden som skapat denna värld heter "Frith", och i världen är alla inledningsvis gräsätare. Men kaninerna blir fler och överbetar av gräset, vilket förargar Frith (som förgäves försöker få kaninernas furste El-Ahrairah att kontrollera sitt folk). Frith ger därefter varje djur olika egenskaper och vissa sätts att jaga kaninerna. Kaninerna får dock snabblöpandets gåva, liksom en viss överlevnadsinstinkt.
Därefter inleds filmberättelsen, som kretsar kring en grupp vildkaniner, bosatta nära Sandleford i Berkshire. Några ur kolonin flyr från den, sedan "Femman" (engelska: "Fiver") anat oråd om att någonting hemskt ska hända. Kaninerna leds av "Hassel" ("Hazel"; äldre bror till Femman) tillsammans med "Femman", som inom sig ser målet för flykten som en högt belägen plats. Resan går sedan genom den engelska landsbygden på jakt efter en plats att slå sig ner, en plats skyddad från allsköns faror. På vägen möter de katter, hundar, rovfåglar och – farligast av dem alla – medlemmar av andra kolonier.
